装置概要

次世代シーケンサーで得られたデータの解析を行います(本学・外注先いずれのデータも可)。
例としてRNA-seqの場合はマッピング、発現定量、群間比較、クラスタリング、PCA、ヒートマップ、GO、パスウェイ(KEGG pathway等)が料金内に含まれます。
解析例として、16SメタゲノムはQiime2, TCRレパトアはMiXCR, 各種nanopore用ソフト,シングルセルはseurat,RNAseqはSTAR-RSEM,変異解析はBWA-GATK等で行っております。
不明な点はお問い合わせください。

設置場所と担当者

設置場所：霞　霞総合研究棟223号室（マップ）
担当者　：森原　なぎさ（内線6870, mail:morihara[at]）

予約・依頼方法

依頼解析のみとなっております。
大学連携研究設備ネットワークよりご予約のうえ、fastq形式等のファイルと解析報告書(外注先より納品のデータの場合)を送付または共有いただくか、直接お持ちください。
データ解析終了後は解析結果と解析報告書を返却します。

料金表

※ターゲットアンプリコン等の小データ量は101サンプルから、RNAseqなどの中データ量は25サンプルから、WholeGenome等の大データ量は3サンプルから同一プロジェクトでも追加料金が発生しますので、お問い合わせください。

学内利用者料金

基本料金	納期
15,000円/プロジェクト	3週間～

学外利用者料金

基本料金	納期
37,500円/プロジェクト	3週間～

仕様

Windows

Linux

過去の解析実績

RNAseq
ターゲットリシーケンス
16Sメタゲノム
TCRレパトア
シングルセル
ナノポアデータ
分子バーコード有の変異解析
マイクロアレイデータ
等