シングルセル解析装置　Chromium X (10x Genomics)

Chromium X (10x Genomics)

装置概要

マイクロ流路内で細胞とゲルビーズを1個ずつ含む液滴を形成し、細胞一つ一つに識別可能なタグ付けをすることで、数百～数万個に及ぶ細胞のシングルセル遺伝子発現解析、シングルセル免疫プロファイリング、シングルセルマルチオーム、空間的遺伝子発現解析などを可能にします。

設置場所と担当者

設置場所：霞　霞総合研究棟110号室（マップ）
担当者　：森原　なぎさ（内線6870, mail:morihara[at]）

予約・依頼方法

予約は大学連携研究設備ネットワークより行ってください。
「設備を検索」から「Chromium」で検索できます。
下の「利用について」をよくお読みいただきご予約下さい。
受託をご利用の方は予約画面に申込書(赤枠内をご記入ください)を添付のうえ、細胞持参日を選択しご予約ください。
機器の故障や利用休止などの情報は大学連携ネットワークの設備ニュースよりご確認ください。

利用について

1.Chromium X は自己運用と受託(cDNA まで)があり、いずれの場合も試薬は利用者ご自身での持ち込みとなっております。
2.初めて利用される際は、受託を利用される場合も含め、必ず実験開始前に10xGenomics社の担当者と細胞調製などの打ち合わせをしますのでお問い合わせください。
3.初めて自己運用される場合は施設担当者が操作説明を行いますので、お問い合わせください。
　使用法説明の前に How to video 視聴とユーザーガイド確認をお願いいたします。
4.受託の場合は大学連携ネットワークで予約された日に細胞をお持ちください。洗浄や懸濁はPBS+0.04%非アセチル化BSAを推奨、セルストレーナーなどで凝集体を除去、細胞濃度700-1200cells/μl、cell viability 90%(少なくとも80%以上)とし、細胞持参の30分前(セルカウント開始前など)にお電話(内線：6870)でご連絡ください。細胞持参の際viabilityに問題が無かったかどうかと細胞濃度をお知らせください。最初の細胞の状態が最も結果に影響を与える実験の性質のため、結果についての責任を負いませんので、ご了承の上ご利用ください。
またエマルジョン不形成が起きた場合、再度エマルジョン形成するかどうか連絡する場合がありますので、細胞提出後1時間程度はお電話がつながる状態にしてください。
5.現在弊部においてscRNA-seqに対応する次世代シーケンサーを所有していないため、シーケンスは外注などをお願いしております。ご不明な方はご相談ください。

料金表

利用料金

※利用料金の中にキット試薬以外の必要消耗品費が全て含まれております。

利用形態	学内利用料金	学外利用料金
自己運用	5,500円/サンプル	6,000円/サンプル
受託(cDNAまで)	7,500円/サンプル	8,000円/サンプル

オプション料金

利用形態	利用料金
ライブラリ依頼作製(cDNA以降)	9,160 円/1～8 サンプル
バイオアナライザー依頼測定	8,930 円/チップ(～11 サンプル)
データ依頼解析(cell ranger, seurat)	15,000円

分割譲渡試薬

※期限が3か月と短いため、4サンプル分のご希望が集まった時点での発注となり、納品後3か月以内のご利用に同意いただける方のみとなっております。

利用形態	利用料金
5'RNA-seq v2用試薬	360,000円/サンプル(2 サンプル目以降は307,750円/サンプル)

仕様

アプリケーション

シングルセル遺伝子発現解析(3'RNA-seq, 5'RNA-seq)
シングルセル免疫プロファイリング(TCR+BCR)
シングルセルATAC
シングルセルマルチオームATAC＋遺伝子発現(3'RNA-seq+ATAC-seq)
ターゲット遺伝子発現
Visium(空間的遺伝子発現解析)
※遺伝子発現解析と免疫プロファイリングについてはハイスループットキットに対応