次世代シーケンサー Miseq (Illumina)

Miseq (Illumina)

装置概要

※クオリティ低下により測定受付停止しておりましたが、学内研究室より移管提供を受け、別装置で2024/10/1より共用再開しました

相補鎖DNAを合成しながら読み取りを行うSequencing By Synthesis (SBS法）を用いています。
リード長は50cycles(bp)～600cycles(bp)で、ペアエンドあるいはシングルリードの選択ができます。
1ラン当たりのデータ量は300Mb～15Gb(100～2500万リード)となり、ターゲットリシーケンスや
16Sメタゲノム、ゲノムサイズの小さい生物種の解析に適しています。
ヒトWholeGenomeやRNAseqの解析には向きません。
1ランあたりが低コストなため、高額シーケンス前のライブラリの品質確認や予備実験が行えます。

設置場所と担当者

設置場所：霞　基礎・社会医学棟6階
担当者　：森原　なぎさ（内線6870, mail:morihara[at]）

予約・依頼方法

作製済みライブラリとシーケンス試薬をお持ち込みいただき、こちらで依頼測定(シーエンス)を行います。
ライブラリ依頼作製 + シーケンス、またはライブラリ作製のみの依頼(シーケンスは外注の場合)も
承っておりますが、その場合もライブラリ作成試薬は各研究室でご購入下さい。
ライブラリQCのみでも受け付けております(QC料金を参照ください)。
予約は大学連携研究設備ネットワークより行ってください。
「設備を検索」から「Miseq」で検索できます。
予約画面に申込書を添付の上、希望日にサンプル提出予定日をご入力ください。
こちらからの承認メールが届きましたら、作成済みライブラリとシーケンスキットを提出ください。
1週間程度でデータをご返却致します。
初めての依頼測定、ライブラリ作製の依頼、ライブラリQCについては予約前に担当者までご相談ください。
機器の故障や利用休止などの情報は大学連携ネットワークの設備ニュースよりご確認ください。

料金表

利用料金

利用形態	利用料金
機器使用料(学内)	25,760円/ラン
機器使用料(学外)	60,810円/ラン

ライブラリ依頼作製時のオプション

内容	利用料金	備考
ライブラリ作製基本料	7,120 円/日	プロトコールにより日数が異なります
ライブラリ作製消耗品費	2,040 円/8サンプルごと	チップやチューブなどの消耗品費です
AMPure XP Beads	3円/ul	ライブラリ精製に使用します
2xKAPA HiFi Mix	8円/ul	16Sなどアンプリコンライブラリの依頼作製時に使用します
Index	500円/サンプル	16Sなどアンプリコンライブラリの依頼作製時に使用します

QC

QCは以下各機器での予約・利用となります。

機器	利用料金
バイオアナライザー依頼測定	5,168 円～/チップ (1チップで11もしくは12サンプル測定可能)
Qubit依頼測定	800円/8サンプルごと
リアルタイムPCR依頼測定	5,500 円/ラン

仕様

シーケンス試薬

以下のいずれかのシーケンス試薬を持ち込みいただきます。
試薬は1回使い切りで、1回につき最大384サンプル測定可能です。
価格は各代理店へお問い合わせください(税抜き定価59,300円～311,200円/キット(2024年10月時点))。

試薬キット	クラスター数(データ量)
Miseq Reagent Micro Kit v2 (300cycles)	400万 (1.2Gb)
Miseq Reagent Nano Kit v2 (300cycles)	100万 (300Mb)
Miseq Reagent Nano Kit v2 (500cycles)	100万 (500Mb)
Miseq Reagent Kit v2 (50cycles)	1500万 (750Mb)
Miseq Reagent Kit v2 (300cycles)	1500万 (4.5Gb)
Miseq Reagent Kit v2 (500cycles)	1500万 (7.5Gb)
Miseq Reagent Kit v3 (150cycles)	2500万 (3.75Gb)
Miseq Reagent Kit v3 (600cycles)	2500万 (15Gb)