次世代シーケンサー Ion PGM (Thermo Fisher)※2023年12月で試薬販売終了
装置概要
1回のランで200 or 400bpの配列を50万~500万reads程度得ることができます。必要データ量や目的に応じて3種類のチップ(316チップ~1G、318チップ~2G)
から選択することが可能です。
ライブラリ作製にIon Chefシステムを使用できるものもあります。
設置場所と担当者
設置場所:霞 霞総合研究棟111号室(マップ)担当者 :入砂 文子(内線6792, mail:irisuna[at])
予約・依頼方法
※メーカー試薬販売が2023年12月で終了のため、すでに購入された方の測定が完了次第共用終了予定です。依頼測定のみのご利用となり、シーケンス試薬は各研究室でご購入後持ち込みいただいております。
ライブラリの依頼作製も行っておりますが、その場合もライブラリ作成試薬は各研究室でご購入下さい。
予約は大学連携研究設備ネットワークより行ってください。
「設備を検索」から「Ion PGM」で検索できます。
予約画面に申込書を添付の上、希望日にサンプル提出予定日をご入力ください。
こちらからの承認メールが届きましたら、作成済みライブラリとシーケンスキットを提出いただき、
1週間程度でデータをご返却致します。
初めての依頼測定、ライブラリ作製の依頼、ライブラリQCについては予約前に担当者までご相談ください。
機器の故障や利用休止などの情報は大学連携ネットワークの設備ニュースよりご確認ください。
料金表
利用料金
利用形態 | 利用料金 |
---|---|
機器使用料(学内) | 10,780円/ラン |
機器使用料(学外) | 28,190円/ラン |
オプション料金
利用形態 | 利用料金 |
---|---|
ライブラリ作製基本料 | 7,120 円/日 |
ライブラリ作製消耗品費 | 2,040 円/8サンプルごと |
Ion Chefシステム使用料 | 6,200 円/ラン |
AMPure XP Beads | 3円/ul |
QC
QCは以下各機器での予約・利用となります。利用形態 | 利用料金 |
---|---|
バイオアナライザー依頼測定 | 5,168 円~/チップ |
Qubit依頼測定 | 800円/8サンプルごと |
リアルタイムPCR依頼測定 | 5,500 円/ラン |
仕様
シーケンス試薬
以下の試薬を持ち込みいただきます。半導体チップは4回または8回分、試薬は8回分のみの販売となりますので、複数回シーケンスする際割安になります。詳細な価格は各代理店にお問い合わせください。
製品名 | サイズ | 価格 |
---|---|---|
Ion 316 Chip Kit v2 BC (4pack) | 4チップ | 約20万円 |
Ion 318 Chip Kit v2 BC (4pack) | 4チップ | 約26万円 |
Ion PGM Hi-Q view Chef Kit | 8ラン | 約35万円 |
Ion PGM Hi-Q view Chef 400 Kit | 8ラン | 約42万円 |
アプリケーション
アンプリコンシーケンス(ターゲットDNAorRNAシーケンス)メタゲノム解析 等